* Данный текст распознан в автоматическом режиме, поэтому может содержать ошибки
704
рестрикциоННые ЭНДоНУкЛеазы
Система рестрикции–модификации (по Kahl, 1995)
mapping or r. analysis – 1. Техника конструирования рестрикционной карты (см.) конкретного участка ДНК, позволяющая определять сайты узнавания (см.) различных рестриктаз (см.) II типа в линейном масштабе: фрагменты анализируемой последовательности, или гена, вырезаются и электрофоретически (см. Электрофорез) разъединяются, затем их размеры сопоставляют и оценивают расстояние между ними на генетической карте (см.). 2. Использование рестриктаз для определения соотношения экзонов (см.) и интронов (см.) в составе к.-л. гена, для чего применяют метод Берка–Шарпа (см. Берка–Шарпа метод) и др. Разрешающая способность метода – до 20 п. н. рестрикционные эндонуклеазы, рестриктазы, р. ферменты * рэстрыкцыйныя эндануклеазы, рэстрыктазы, р. ферменты * restriction endonucleases or restriction enzymes – любой бактериальный фермент, узнающий определенные нуклеотидные последовательности (сайты узнавания, см.) в двунитчатой ДНК и катализирующий разрыв внутренних связей между специфическими нуклеотидами с образованием двунитчатых разрывов с липкими или тупыми концами. Р. э., действующие на одинаковые последовательности нуклеотидов, называются изошизомерами (см.), активность которых часто зависит от метилирования нуклеотидов в сайте рестрик-
ции (см.). Название рестриктазы образуется из начальных букв названия вида бактерии (напр., Escherichia coli – Eco, Bacillus amyloliquefacience – Bam) и названия штамма или типа функции (EcoR, BamH). Если какой-то хозяйский штамм имеет несколько рестрикционных ферментов, то они обозначаются римскими цифрами (EcoR I, EcoR V, Hind II), отражающими хронологию их открытия. Сайт узнавания и место разрезания обозначаются следующим образом (для EcoR I):
1 1 1 1 51 ? GAA TTC ? 31 1 1 31 ? CTT A AG ? 51 31 ? CTT A AG ? 51 ^ ^ ^ v v v
Р. э. можно разбить на 3 класса. Р. э. 1-го класса включают 3 субъединицы (R – рестрикция; M – метилирование, S – последовательность узнавания). Они проявляют функции модификации и рестрикции, место разрезания здесь не является специфичным; ферменты этого класса не используются в технологии рекомбинантной ДНК. Р. э. 2-го класса узнают и разрывают двунитчатую ДНК в пределах определенной последовательности, состоящей из 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеотидов. Этот класс, в свою очередь, подразделяется на несколько подклассов. Р. э. 3-го класса состоят из двух субъединиц, узнающих короткие несимметричные последовательности, связывающих-